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Identification of a fragment of the internal transcribed spacer region of rDNA in Cenchrus purpureus (Poaceae) Identificación de un fragmento de la región del espaciador interno transcrito del ADNr en Cenchrus purpureus (Poaceae) Hernández Montesinos, A.R. Recio, María E. Carvajal Yepes, Mónica Arango, J. Rodríguez Alfonso, Daymara Fortes González, Dayleni Herrera García, R.S. forage genome ITS molecular marker PCR forraje genoma ITS marcador molecular PCR The internal transcribed spacer (ITS) region is easy to amplify due to its numerous copies present in the plant genome, but there in not researchers of this region in the forage species Cenchrus purpureus. This study aimed to identify by Polymerase Chain Reaction (PCR) a fragment of the ITS region of the ribosomal DNA of the nucleus in C. purpureus using the primers ITS1/ITS4 and compare it with two samples of Urochloa spp. The molecular study used DNA samples from 62 C. purpureus accessions from the grass and forage germplasm bank belonging to Instituto de Ciencia Animal and two samples of Urochloa spp. accessions from the Genetic Resources Program of the Alliance of International Bioversity and the International Center for Tropical Agriculture. The DNA from the 62 C. purpureus accessions and Urochloa spp. controls were amplified with ITS1/ITS4 primers. The amplification products revealed a clear polymorphic band in the gels for each accession and an approximate size of 1000 bp in C. purpureus and 850 bp in Urochloa spp. The primers determined differences in amplifications between samples of C. purpureus and Urochloa spp. although they did not show variability between accessions of the same species. These molecular markers can be used to verify PCR amplification of C. purpureus DNA samples and to differentiate species in Poaceae genera. La región del espaciador interno transcrito (ITS), es fácil de amplificar por sus numerosas copias presentes en el genoma vegetal, pero no se reportan investigaciones de esta región en la especie forrajera Cenchrus purpureus. El presente estudio tuvo como objetivo identificar mediante Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) un fragmento de la región ITS del ADN ribosomal del núcleo en C. purpureus mediante los cebadores ITS1/ ITS4 y compararlo con dos muestras de Urochloa spp. En el estudio molecular se emplearon muestras de ADN de 62 accesiones de C. purpureus del banco de germoplasma de pastos y forrajes, pertenecientes al Instituto de Ciencia Animal y dos muestras de accesiones de Urochloa spp. del Programa de Recursos Genéticos de la Alianza de Bioversity International y el Centro Internacional de Agricultura Tropical. El ADN de las 62 accesiones de C. purpureus y muestras de Urochloa spp., amplificaron con los cebadores ITS1/ITS4. Los productos de amplificación revelaron una banda polimórfica nítida en los geles para cada accesión y tamaño aproximado de 1000 pb en C. purpureus y 850 pb en Urochloa spp. Los cebadores determinaron diferencias en las amplificaciones entre las muestras de C. purpureus y Urochloa spp. aunque no demostraron variabilidad entre accesiones de la misma especie. Estos marcadores moleculares se pueden utilizar para comprobar la amplificación, mediante PCR, de muestras de ADN de C. purpureus y en la diferenciación de especies en géneros de Poaceae. Instituto de Ciencia Animal 2025-11-03 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf application/pdf text/html application/epub+zip application/zip https://cjascience.com/index.php/CJAS/article/view/1181 Cuban Journal of Agricultural Science; Vol. 59 (2025): January-December ; https://cu-id.com/1996/v59e13 Cuban Journal of Agricultural Science; Vol. 59 (2025): January-December ; https://cu-id.com/1996/v59e13 2079-3480 0864-0408 eng spa https://cjascience.com/index.php/CJAS/article/view/1181/1814 https://cjascience.com/index.php/CJAS/article/view/1181/1815 https://cjascience.com/index.php/CJAS/article/view/1181/1836 https://cjascience.com/index.php/CJAS/article/view/1181/1837 https://cjascience.com/index.php/CJAS/article/view/1181/1838 Copyright (c) 2025 Revista bajo Licencia CC Reconocimiento-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0) https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0